财务管理在风险投资中的重要性是不言而喻的，他包括风险投资机构本身及对所投项目企业进行财务管理。在这一过程中，对人的管理，对制度的设计,是最基础的工作，也是最重要的工作环节。
一、人员管理
风险投资做为知识经济社会中技术创新与金融创新相结合而生成的一种新型事物，其能否成功在很大程度上取决于对人的管理。财务上对人的管理，即对在风险投资这个特定行业做财务管理工作人员的培养和管理。完善的制度都是人制定的，而它的执行与实施效果完全是依赖于人的素质与能力而定。如果没有适当的财务管理人员，就无法满足公司对投资企业的财务管理需要。
二、 制度设计
设计财务管理制度，也就是通过一定的程序和系统、一定的规章制度保证对投资企业管理的有效实施。风险投资的财务管理应该是一个系统，对于投资项目来说，它起始于项目的考察论证阶段，结束于项目资本变现退出以后，贯穿于风险投资公司从资金---资本化---资金的长循环之中。
1、投资前期财务评价
项目投资前的财务评价很重要，它关系到投资项目的价值认定问题，没有较大价值的项目是不值得投资的，但投资的价值点在何处，它是否真实可靠，这不能仅仅根据项目的技术是否先进，有没有市场来定性判断，还要做细致的经济可行性及投资价值的评价。财务评价是其中重要的一部分。缺乏财务评价的经济可行性是令人怀疑的。在公司的投资决策程序中，其中一个环节就是投资项目的可行性论证由财务部门参与并出具财务审核意见。对投资项目的投资前调查与了解是否充分，对其价值的判断是否准确，定价是否合理，谈判条件是否有利，直接决定了投资后管理的难度，也决定了将来退出时获利空间的大小，因此，投资前的尽职调查和各种评审就显得非常重要。财务部门对可行性报告出具财务审核意见,可以从不同的角度分析项目的投资价值，规避投资风险,为领导决策提供参考。
2、投资企业动态财务管理
对已投资项目的管理是风险投资实现增值的必然阶段。一般在公司与投资企业签定合同文本时,从财务审核与监督的角度出发，专门设计了财务管理方面的约定，其中包括由风险投资公司委派财务经理的约定，指定会计师事务所审计的约定，对股东定期公布财务信息的约定等等。这些必要的法律文件从制度上保证了风险投资公司对投资企业的管理权和监控权，从而更好地保证了风险投资公司在投资企业的收益权。
三、管理手段
在财务管理具体实践中，实行纵横交叉的网络式管理，可以既保证对投资企业的动态全面了解，又重点掌控一些核心企业。